| 発行日 | 種類 | タイトル | 発行所 | 判型 | 備考 | |
| 1975年10月05日号 | - | 週刊少年マガジン | 講談社 | B5判 | 読切連載 | - |
| 1978年08月30日 | 手塚治虫漫画全集104巻 | 三つ目がとおる4 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1986年07月05日 | KCコミックス251巻 | 三つ目がとおる1 | 講談社 | B6判 | - | - |
| 1998年12月10日 | 講談社漫画文庫 | 三つ目がとおる1 | 講談社 | 文庫判 | - |
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| 2001年07月10日 | ちくま文庫 | 手塚治虫SF傑作集「異星人編」 | 筑摩書房 | 文庫判 | 二階堂黎人・選 |
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| 2003年06月11日 | プラチナコミックス | 三つ目がとおる"怪植物ボルボックI" | 講談社 | B6判 | - | - |
| 2012年06月01日 | GAMANGA BOOKS | 三つ目がとおる"グリーブの秘密" | 小学館 | B6判 | - |
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| 2017年12月28日 | 三つ目がとおる3＜オリジナル版＞大全集 | - | 復刊ドットコム | B5判 | - |
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