| 発行日 | 種類 | タイトル | 発行所 | 判型 | 備考 | |
| 1975年10月19日〜1976年03月07日 | - | 週刊少年マガジン | 講談社 | B5判 | 読切連載 | - |
| 1976年12月20日 | 講談社コミックス | 三つ目がとおる5 | 講談社 | 新書判 | - | - |
| 1977年09月20日 | 講談社コミックス | 三つ目がとおる6 | 講談社 | 新書判 | - | - |
| 1980年11月20日 | 手塚治虫漫画全集111巻 | 三つ目がとおる11 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1981年01月20日 | 手塚治虫漫画全集112巻 | 三つ目がとおる12 | 講談社 | B6判 | - |
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| 1986年10月06日 | KCコミックス254巻 | 三つ目がとおる4 | 講談社 | B6判 | - | - |
| 1999年01月12日 | 講談社漫画文庫 | 三つ目がとおる4 | 講談社 | 文庫判 | - |
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| 2003年06月11日 | プラチナコミックス | 三つ目がとおる"怪植物ボルボックI" | 講談社 | B6判 | - | - |
| 2003年06月25日 | プラチナコミックス | 三つ目がとおる"怪植物ボルボックII" | 講談社 | B6判 | - | - |
| 2012年06月01日 | GAMANGA BOOKS | 三つ目がとおる"グリーブの秘密" | 小学館 | B6判 | - |
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| 2012年06月01日 | GAMANGA BOOKS | 三つ目がとおる"怪植物ボルボック" | 小学館 | B6判 | - |
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| 2017年12月28日 | 三つ目がとおる3＜オリジナル版＞大全集 | - | 復刊ドットコム | B5判 | - |
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| 2018年02月25日 | 三つ目がとおる4＜オリジナル版＞大全集 | - | 復刊ドットコム | B5判 | - |
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